Rilevazione accurata della mutazione somatica di basso livello nell'epilessia intrattabile
Gli scienziati medici KAIST hanno sviluppato un metodo avanzato per rilevare perfettamente la mutazione somatica di basso livello nei pazienti con epilessia intrattabile. Il loro studio ha dimostrato che i replicati del sequenziamento profondo dei principali geni dell'epilessia focale hanno identificato in modo accurato ed efficiente mutazioni somatiche di basso livello nell'epilessia intrattabile.
Secondo lo studio, il loro metodo diagnostico potrebbe aumentare l'accuratezza fino al 100%, a differenza dell'analisi di sequenziamento convenzionale, che si attesta a circa il 30% di accuratezza. Questo lavoro è stato pubblicato su Acta Neuropathologica .
L'epilessia è un disturbo neurologico comune nei bambini. Circa un terzo dei pazienti pediatrici viene diagnosticato un'epilessia intrattabile nonostante un adeguato trattamento farmacologico antiepilettico.
Le mutazioni somatiche nei geni della via mTOR, SLC35A2 e BRAF sono le principali cause genetiche delle epilessie intrattabili. Una sperimentazione clinica volta a colpire la displasia corticale focale di tipo II (FCDII), l'inibitore mTOR è in corso presso il Severance Hospital, il loro collaboratore a Seoul, in Corea. Tuttavia, è difficile rilevare tali mutazioni somatiche che causano epilessia intrattabile perché il loro carico mutazionale è inferiore al 5%, che è simile al livello di artefatti di sequenziamento. In campo clinico, questa è rimasta una sfida permanente per la diagnosi genetica delle mutazioni somatiche nell'epilessia intrattabile.
Il team del professor Jeong Ho Lee della Graduate School of Medical Science and Engineering ha analizzato il cervello e i tessuti periferici accoppiati da 232 pazienti con epilessia intrattabile con varie patologie cerebrali al Severance Hospital usando il sequenziamento profondo ed estratto i principali geni dell'epilessia focale.
Hanno ridotto i geni target a otto principali geni dell'epilessia focale, eliminando quasi tutte le chiamate falsi positivi usando un sequenziamento mirato profondo. Di conseguenza, il metodo avanzato ha aumentato notevolmente l'accuratezza e ha permesso loro di rilevare mutazioni somatiche di basso livello in campioni di cervello ineguagliati con formina fissa di paraffina (FFPE), i campioni clinicamente più rilevanti.
Il professor Lee ha condotto questo studio in collaborazione con il professor Dong Suk Kim e Hoon-Chul Kang presso il Severance Hospital dell'Università di Yonsei. Ha detto: "Questo metodo avanzato di analisi genetica migliorerà la cura generale dei pazienti fornendo una consulenza genetica più completa e informando le decisioni su trattamenti alternativi".
Il professor Lee ha studiato le mutazioni somatiche di basso livello che si presentano nel cervello per un decennio. Sta sviluppando una diagnostica e una terapia innovative per disturbi cerebrali non trattabili, tra cui epilessia intrattabile e glioblastoma, in una startup tecnologica chiamata SoVarGen. "Tutte le tecnologie che abbiamo utilizzato durante la ricerca sono state trasferite all'azienda. Questa ricerca ci ha dato un ottimo impulso per raggiungere la fase successiva della nostra startup", ha osservato.
Il lavoro è stato supportato da sovvenzioni della Suh Kyungbae Foundation, una sovvenzione della National Research Foundation della Corea finanziata dal Ministero della Scienza e delle TIC, dal progetto coreano di R&S sulle tecnologie sanitarie del Ministero della salute e del benessere e dall'Organizzazione olandese per la ricerca sanitaria e Sviluppo.